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DNA片段分選試劑盒適用于不同基因組應用中的DNA片段純化、分選。本產(chǎn)品適用于PCR/qPCR/ddPCR、二代測序(NGS)、基因芯片等DNA片段的純化、分選。本產(chǎn)品可適用于市場上各品牌及實驗室自建的PCR體系、NGS DNA、RNA建庫試劑盒。使用方式跟AMPure XP beads 相同,且片段大小分布高度吻合。
DNA片段分選試劑盒基于SPRI技術(shù)(固相載體可逆固定化)的原理,采用高性能磁珠和獨特緩沖液體系,通過調(diào)整試劑與樣本的比例,無需割膠、芯片或者專用設備即可實現(xiàn)100 bp~1000 bp范圍內(nèi)的DNA片段的選擇性純化與分選使用本試劑盒可有效去除反應體系中的dNTP、鹽離子、引物、引物二聚體及其他雜質(zhì)等,所得DNA片段純度高,片段長度一致性好、片段大小滿足測序儀要求,可用于手動操作或自動化工作站高通量操作。
片段分選試劑盒工作原理
文獻介紹在一定濃度的鹽與PEG溶液中,DNA分子構(gòu)象會發(fā)生變化,暴露出大量的帶負電荷的磷酸基團,在鹽離子作用下可以與羧基磁珠結(jié)合,溶液中鹽與PEG濃度越高,羧基磁珠可結(jié)合的DNA片段越小。當DNA片段被特異性的吸附到磁珠上,利用磁珠的磁性,通過外加磁場使其與溶液進行分離,去除含有PEG和鹽的溶液,然后進一步洗滌去除磁珠上殘留的PEG和鹽。然后加入洗脫液, DNA片段就又可以從磁珠上被洗脫下來,得到經(jīng)過分選及純化的DNA。
本產(chǎn)品為含羧基磁珠和聚乙二醇(PEG)等物質(zhì)的鹽溶液。實驗過程中通過控制試劑與樣本體積比,來控制溶液中PEG和鹽的濃度,將不同長度的DNA片段結(jié)合到磁珠上并進行分選和純化。
本產(chǎn)品進行DNA長度分選的實驗流程參考圖如下:
特異性強、DNA結(jié)合量高
本產(chǎn)品對不同大小的核酸片段可以快速進行分離純化,無需割膠,DNA結(jié)合速度快、結(jié)合量高。而且磁珠粒徑小,不易產(chǎn)生非特異吸附,可以快速有效去除dNTP、引物、引物二聚體、鹽和其它污染物;
分選長度范圍廣(產(chǎn)物100bp-1000bp)
產(chǎn)品可通過調(diào)整試劑用量從而調(diào)整分選DNA長度的范圍以適應不同實驗的需求。不同批次之間結(jié)果具有一致性。分選片段范圍與實驗預設一致,實驗結(jié)果可預測。
分選效率高
產(chǎn)品采用磁性分離,無需離心,有助于保留核酸的完整性,DNA片段分選純化回收率高;
1、可以用于DNA文庫的構(gòu)建
在基因組測序中,需要先將DNA打斷成一定長度的片段,然后通過PCR擴增這些片段,最后將這些片段克隆到載體上,形成DNA文庫。在這個過程中,片段分選磁珠可以用于選擇性地富集特定長度的DNA片段,從而提高文庫的質(zhì)量。
2、可以用于基因組重測序
基因組重測序是一種研究基因組變異的重要方法,它可以揭示基因組的結(jié)構(gòu)、功能和演化等信息。在這個過程中,DNA片段選擇磁珠可以用于選擇性地富集特定的DNA片段,從而提高測序的準確性和效率。
3、可以用于基因表達譜的研究
基因表達譜是一種描述基因在不同條件下表達情況的方法,它可以揭示基因的功能和調(diào)控機制。在這個過程中,DNA片段選擇磁珠可以用于選擇性地富集特定類型的RNA分子,從而提高表達譜的準確性和深度。
4、可以用于染色體組裝和結(jié)構(gòu)研究
染色體組裝是指將測序得到的短讀序列重新組裝成連續(xù)的染色體序列,而染色體結(jié)構(gòu)研究則是研究染色體的空間結(jié)構(gòu)和功能。在這個過程中,片段分選磁珠可以用于選擇性地富集特定的DNA片段,從而提高組裝和結(jié)構(gòu)分析的準確性和效率。